Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgm3Q08189 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms