Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

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Length 1,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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Cntn3Q07409 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Cntn3Q07409 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Cntn3Q07409 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Cntn3Q07409 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Cntn3Q07409 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Cntn3Q07409 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
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Cntn3Q07409 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Cntn3Q07409 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Cntn3Q07409 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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