Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms