Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms