Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 CT030135.2-201ENSMUST00000225255 893 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Etv1-205ENSMUST00000160856 1474 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Gm43854-201ENSMUST00000200418 394 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Gm42511-201ENSMUST00000196160 234 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Arhgef33-210ENSMUST00000225548 456 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms