Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms