Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms