Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cbx1P83917 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cbx1P83917 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cbx1P83917 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cbx1P83917 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cbx1P83917 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cbx1P83917 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cbx1P83917 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cbx1P83917 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cbx1P83917 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cbx1P83917 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cbx1P83917 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cbx1P83917 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cbx1P83917 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cbx1P83917 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cbx1P83917 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cbx1P83917 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cbx1P83917 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cbx1P83917 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cbx1P83917 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cbx1P83917 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cbx1P83917 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cbx1P83917 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cbx1P83917 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cbx1P83917 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cbx1P83917 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cbx1P83917 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cbx1P83917 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cbx1P83917 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cbx1P83917 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cbx1P83917 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cbx1P83917 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cbx1P83917 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cbx1P83917 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cbx1P83917 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cbx1P83917 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cbx1P83917 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cbx1P83917 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cbx1P83917 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cbx1P83917 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cbx1P83917 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cbx1P83917 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cbx1P83917 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cbx1P83917 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cbx1P83917 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cbx1P83917 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cbx1P83917 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cbx1P83917 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cbx1P83917 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cbx1P83917 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cbx1P83917 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cbx1P83917 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cbx1P83917 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cbx1P83917 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cbx1P83917 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cbx1P83917 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cbx1P83917 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cbx1P83917 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cbx1P83917 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cbx1P83917 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cbx1P83917 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cbx1P83917 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cbx1P83917 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cbx1P83917 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cbx1P83917 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cbx1P83917 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cbx1P83917 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cbx1P83917 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms