Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Otx1P80205 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Otx1P80205 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Otx1P80205 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Otx1P80205 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Otx1P80205 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Otx1P80205 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Otx1P80205 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Otx1P80205 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Otx1P80205 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms