Protein–RNA interactions for Protein: P70321

Hoxb13, Homeobox protein Hox-B13, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb13P70321 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb13P70321 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb13P70321 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb13P70321 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb13P70321 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb13P70321 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb13P70321 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb13P70321 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb13P70321 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb13P70321 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb13P70321 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb13P70321 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb13P70321 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb13P70321 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb13P70321 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb13P70321 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb13P70321 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb13P70321 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb13P70321 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb13P70321 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb13P70321 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb13P70321 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb13P70321 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb13P70321 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb13P70321 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb13P70321 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb13P70321 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb13P70321 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb13P70321 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb13P70321 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb13P70321 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb13P70321 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb13P70321 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb13P70321 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb13P70321 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb13P70321 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxb13P70321 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxb13P70321 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxb13P70321 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxb13P70321 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxb13P70321 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxb13P70321 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxb13P70321 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Hoxb13P70321 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Hoxb13P70321 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Hoxb13P70321 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Hoxb13P70321 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Hoxb13P70321 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
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