Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Chl1P70232 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chl1P70232 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chl1P70232 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chl1P70232 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chl1P70232 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chl1P70232 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Chl1P70232 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chl1P70232 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms