Protein–RNA interactions for Protein: P63024

Vamp3, Vesicle-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp3P63024 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Shroom2-201ENSMUST00000062317 6997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Ryr1-202ENSMUST00000179893 15358 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Btbd7-206ENSMUST00000223554 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Gm19972-201ENSMUST00000218180 5664 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Svil-204ENSMUST00000127297 6243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Gm5860-202ENSMUST00000151038 1711 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Cspg4-201ENSMUST00000035661 8121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Rassf2-201ENSMUST00000028814 8233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Limch1-202ENSMUST00000101164 5192 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 9330175E14Rik-201ENSMUST00000180445 4852 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Utrn-206ENSMUST00000219003 5751 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vamp3P63024 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vamp3P63024 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Vamp3P63024 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vamp3P63024 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vamp3P63024 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vamp3P63024 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vamp3P63024 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vamp3P63024 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vamp3P63024 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vamp3P63024 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Vamp3P63024 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vamp3P63024 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vamp3P63024 Dusp16-201ENSMUST00000100857 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vamp3P63024 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vamp3P63024 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vamp3P63024 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vamp3P63024 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms