Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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