Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ppfia3P60469 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ppfia3P60469 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ppfia3P60469 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ppfia3P60469 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ppfia3P60469 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ppfia3P60469 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ppfia3P60469 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ppfia3P60469 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ppfia3P60469 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ppfia3P60469 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ppfia3P60469 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ppfia3P60469 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ppfia3P60469 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ppfia3P60469 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ppfia3P60469 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ppfia3P60469 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ppfia3P60469 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ppfia3P60469 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ppfia3P60469 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ppfia3P60469 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ppfia3P60469 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ppfia3P60469 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ppfia3P60469 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ppfia3P60469 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ppfia3P60469 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ppfia3P60469 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ppfia3P60469 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ppfia3P60469 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ppfia3P60469 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ppfia3P60469 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ppfia3P60469 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ppfia3P60469 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ppfia3P60469 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ppfia3P60469 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ppfia3P60469 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ppfia3P60469 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ppfia3P60469 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ppfia3P60469 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ppfia3P60469 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ppfia3P60469 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ppfia3P60469 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ppfia3P60469 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ppfia3P60469 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ppfia3P60469 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ppfia3P60469 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ppfia3P60469 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ppfia3P60469 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ppfia3P60469 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ppfia3P60469 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ppfia3P60469 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ppfia3P60469 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ppfia3P60469 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Ppfia3P60469 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ppfia3P60469 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ppfia3P60469 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ppfia3P60469 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ppfia3P60469 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ppfia3P60469 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ppfia3P60469 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ppfia3P60469 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ppfia3P60469 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ppfia3P60469 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ppfia3P60469 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ppfia3P60469 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ppfia3P60469 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ppfia3P60469 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ppfia3P60469 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ppfia3P60469 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ppfia3P60469 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ppfia3P60469 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ppfia3P60469 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ppfia3P60469 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ppfia3P60469 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ppfia3P60469 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ppfia3P60469 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ppfia3P60469 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ppfia3P60469 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ppfia3P60469 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ppfia3P60469 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ppfia3P60469 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ppfia3P60469 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ppfia3P60469 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ppfia3P60469 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ppfia3P60469 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ppfia3P60469 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ppfia3P60469 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ppfia3P60469 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ppfia3P60469 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ppfia3P60469 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ppfia3P60469 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ppfia3P60469 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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