Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CckbrP56481 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CckbrP56481 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CckbrP56481 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CckbrP56481 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CckbrP56481 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CckbrP56481 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CckbrP56481 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CckbrP56481 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CckbrP56481 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CckbrP56481 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CckbrP56481 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CckbrP56481 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CckbrP56481 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CckbrP56481 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CckbrP56481 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CckbrP56481 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CckbrP56481 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CckbrP56481 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CckbrP56481 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CckbrP56481 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CckbrP56481 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CckbrP56481 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CckbrP56481 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CckbrP56481 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CckbrP56481 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CckbrP56481 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CckbrP56481 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CckbrP56481 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CckbrP56481 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CckbrP56481 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CckbrP56481 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CckbrP56481 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CckbrP56481 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CckbrP56481 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CckbrP56481 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CckbrP56481 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CckbrP56481 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CckbrP56481 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CckbrP56481 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CckbrP56481 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CckbrP56481 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CckbrP56481 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CckbrP56481 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CckbrP56481 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CckbrP56481 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CckbrP56481 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CckbrP56481 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CckbrP56481 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CckbrP56481 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CckbrP56481 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CckbrP56481 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CckbrP56481 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CckbrP56481 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CckbrP56481 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CckbrP56481 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CckbrP56481 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CckbrP56481 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CckbrP56481 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CckbrP56481 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CckbrP56481 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CckbrP56481 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CckbrP56481 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CckbrP56481 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CckbrP56481 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CckbrP56481 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CckbrP56481 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CckbrP56481 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CckbrP56481 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CckbrP56481 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CckbrP56481 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CckbrP56481 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CckbrP56481 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CckbrP56481 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CckbrP56481 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CckbrP56481 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CckbrP56481 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CckbrP56481 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CckbrP56481 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CckbrP56481 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CckbrP56481 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CckbrP56481 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CckbrP56481 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CckbrP56481 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CckbrP56481 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CckbrP56481 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
CckbrP56481 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CckbrP56481 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
CckbrP56481 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CckbrP56481 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
CckbrP56481 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
CckbrP56481 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CckbrP56481 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CckbrP56481 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
CckbrP56481 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CckbrP56481 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CckbrP56481 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CckbrP56481 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
CckbrP56481 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CckbrP56481 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms