Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NcanP55066 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NcanP55066 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NcanP55066 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NcanP55066 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NcanP55066 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NcanP55066 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NcanP55066 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NcanP55066 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NcanP55066 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NcanP55066 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NcanP55066 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NcanP55066 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NcanP55066 Ighv7-1-201ENSMUST00000103474 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NcanP55066 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NcanP55066 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NcanP55066 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NcanP55066 Rpsa-ps5-201ENSMUST00000121462 885 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NcanP55066 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NcanP55066 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NcanP55066 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NcanP55066 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NcanP55066 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NcanP55066 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NcanP55066 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NcanP55066 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NcanP55066 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NcanP55066 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NcanP55066 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NcanP55066 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NcanP55066 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NcanP55066 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NcanP55066 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NcanP55066 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NcanP55066 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NcanP55066 Matr3-216ENSMUST00000190653 1846 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NcanP55066 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NcanP55066 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NcanP55066 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NcanP55066 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NcanP55066 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NcanP55066 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NcanP55066 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NcanP55066 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NcanP55066 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NcanP55066 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NcanP55066 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NcanP55066 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NcanP55066 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NcanP55066 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NcanP55066 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NcanP55066 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NcanP55066 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NcanP55066 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NcanP55066 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NcanP55066 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NcanP55066 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NcanP55066 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NcanP55066 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NcanP55066 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NcanP55066 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NcanP55066 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NcanP55066 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NcanP55066 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NcanP55066 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NcanP55066 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NcanP55066 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NcanP55066 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NcanP55066 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NcanP55066 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NcanP55066 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NcanP55066 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NcanP55066 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NcanP55066 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NcanP55066 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NcanP55066 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NcanP55066 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NcanP55066 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NcanP55066 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NcanP55066 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NcanP55066 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NcanP55066 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NcanP55066 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NcanP55066 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NcanP55066 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NcanP55066 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NcanP55066 Deup1-201ENSMUST00000045513 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NcanP55066 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NcanP55066 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NcanP55066 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NcanP55066 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NcanP55066 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NcanP55066 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NcanP55066 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NcanP55066 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NcanP55066 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NcanP55066 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NcanP55066 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NcanP55066 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NcanP55066 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms