Protein–RNA interactions for Protein: P51612

Xpc, DNA repair protein complementing XP-C cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XpcP51612 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XpcP51612 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XpcP51612 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XpcP51612 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XpcP51612 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XpcP51612 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XpcP51612 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XpcP51612 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XpcP51612 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XpcP51612 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XpcP51612 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XpcP51612 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XpcP51612 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XpcP51612 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XpcP51612 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XpcP51612 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XpcP51612 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XpcP51612 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XpcP51612 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XpcP51612 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XpcP51612 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XpcP51612 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XpcP51612 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XpcP51612 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XpcP51612 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XpcP51612 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XpcP51612 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
XpcP51612 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
XpcP51612 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XpcP51612 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XpcP51612 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XpcP51612 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XpcP51612 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XpcP51612 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XpcP51612 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XpcP51612 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
XpcP51612 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XpcP51612 Olfr1233-204ENSMUST00000216561 1192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XpcP51612 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XpcP51612 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
XpcP51612 AC154757.2-201ENSMUST00000228885 743 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
XpcP51612 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XpcP51612 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XpcP51612 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XpcP51612 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XpcP51612 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XpcP51612 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XpcP51612 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XpcP51612 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XpcP51612 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XpcP51612 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XpcP51612 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XpcP51612 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XpcP51612 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XpcP51612 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XpcP51612 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XpcP51612 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XpcP51612 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XpcP51612 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XpcP51612 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XpcP51612 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XpcP51612 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XpcP51612 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XpcP51612 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XpcP51612 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XpcP51612 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XpcP51612 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XpcP51612 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XpcP51612 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XpcP51612 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XpcP51612 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XpcP51612 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XpcP51612 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XpcP51612 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XpcP51612 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XpcP51612 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XpcP51612 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XpcP51612 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
XpcP51612 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XpcP51612 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XpcP51612 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XpcP51612 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XpcP51612 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
XpcP51612 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
XpcP51612 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XpcP51612 Gm29013-201ENSMUST00000187431 237 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
XpcP51612 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XpcP51612 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XpcP51612 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
XpcP51612 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
XpcP51612 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XpcP51612 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XpcP51612 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XpcP51612 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XpcP51612 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XpcP51612 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XpcP51612 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XpcP51612 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XpcP51612 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XpcP51612 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92 ms