Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LmnaP48678 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LmnaP48678 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LmnaP48678 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LmnaP48678 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LmnaP48678 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LmnaP48678 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LmnaP48678 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms