Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms