Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LTBRP36941 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LTBRP36941 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LTBRP36941 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LTBRP36941 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LTBRP36941 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LTBRP36941 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LTBRP36941 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LTBRP36941 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LTBRP36941 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LTBRP36941 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LTBRP36941 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LTBRP36941 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LTBRP36941 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LTBRP36941 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LTBRP36941 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LTBRP36941 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LTBRP36941 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LTBRP36941 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LTBRP36941 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LTBRP36941 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LTBRP36941 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LTBRP36941 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LTBRP36941 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LTBRP36941 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LTBRP36941 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LTBRP36941 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LTBRP36941 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LTBRP36941 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LTBRP36941 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LTBRP36941 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LTBRP36941 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LTBRP36941 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LTBRP36941 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LTBRP36941 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LTBRP36941 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LTBRP36941 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LTBRP36941 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LTBRP36941 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LTBRP36941 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LTBRP36941 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LTBRP36941 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LTBRP36941 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LTBRP36941 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LTBRP36941 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LTBRP36941 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LTBRP36941 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LTBRP36941 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LTBRP36941 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LTBRP36941 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LTBRP36941 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LTBRP36941 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LTBRP36941 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LTBRP36941 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LTBRP36941 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LTBRP36941 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LTBRP36941 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LTBRP36941 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LTBRP36941 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LTBRP36941 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LTBRP36941 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LTBRP36941 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LTBRP36941 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LTBRP36941 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LTBRP36941 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LTBRP36941 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LTBRP36941 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LTBRP36941 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LTBRP36941 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LTBRP36941 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LTBRP36941 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LTBRP36941 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LTBRP36941 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LTBRP36941 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LTBRP36941 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LTBRP36941 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LTBRP36941 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LTBRP36941 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LTBRP36941 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LTBRP36941 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LTBRP36941 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LTBRP36941 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LTBRP36941 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LTBRP36941 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LTBRP36941 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LTBRP36941 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LTBRP36941 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LTBRP36941 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LTBRP36941 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LTBRP36941 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LTBRP36941 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LTBRP36941 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LTBRP36941 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LTBRP36941 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LTBRP36941 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LTBRP36941 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LTBRP36941 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LTBRP36941 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LTBRP36941 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LTBRP36941 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms