Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp4P35123 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp4P35123 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp4P35123 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp4P35123 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp4P35123 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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