Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Saa4P31532 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Saa4P31532 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Saa4P31532 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Saa4P31532 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Saa4P31532 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Saa4P31532 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Saa4P31532 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Saa4P31532 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Saa4P31532 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Saa4P31532 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Saa4P31532 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Saa4P31532 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Saa4P31532 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms