Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 Gm28011-201ENSMUST00000184097 175 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 Gm37724-201ENSMUST00000195240 1221 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 C030015E24Rik-201ENSMUST00000198148 828 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 Olfr510-201ENSMUST00000076289 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 Eif3s6-ps4-201ENSMUST00000202873 1388 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 Olfr197-202ENSMUST00000207772 1320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 Gm13206-201ENSMUST00000129579 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 Gm32554-201ENSMUST00000196310 970 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 1700108N06Rik-201ENSMUST00000196572 681 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 4930437M23Rik-201ENSMUST00000197456 968 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 Gm43358-201ENSMUST00000199217 970 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 6030400A10Rik-201ENSMUST00000199734 1212 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 Gm43131-201ENSMUST00000200042 969 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 Gm6563-201ENSMUST00000056396 869 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 Olfr1145-201ENSMUST00000079711 945 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 Olfr1137-201ENSMUST00000099850 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 Araf-202ENSMUST00000120356 1520 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 Gm15394-201ENSMUST00000119656 1308 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxa2P31245 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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