Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VtnP29788 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VtnP29788 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VtnP29788 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VtnP29788 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
VtnP29788 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VtnP29788 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
VtnP29788 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
VtnP29788 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
VtnP29788 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
VtnP29788 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VtnP29788 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
VtnP29788 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VtnP29788 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
VtnP29788 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
VtnP29788 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VtnP29788 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
VtnP29788 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
VtnP29788 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VtnP29788 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VtnP29788 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VtnP29788 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VtnP29788 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
VtnP29788 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VtnP29788 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VtnP29788 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
VtnP29788 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
VtnP29788 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
VtnP29788 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VtnP29788 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VtnP29788 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VtnP29788 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VtnP29788 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
VtnP29788 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VtnP29788 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VtnP29788 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VtnP29788 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VtnP29788 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VtnP29788 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VtnP29788 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VtnP29788 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VtnP29788 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VtnP29788 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VtnP29788 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VtnP29788 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VtnP29788 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
VtnP29788 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VtnP29788 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VtnP29788 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
VtnP29788 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
VtnP29788 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VtnP29788 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VtnP29788 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VtnP29788 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VtnP29788 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VtnP29788 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VtnP29788 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VtnP29788 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VtnP29788 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VtnP29788 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
VtnP29788 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
VtnP29788 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VtnP29788 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VtnP29788 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
VtnP29788 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
VtnP29788 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
VtnP29788 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
VtnP29788 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VtnP29788 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
VtnP29788 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VtnP29788 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
VtnP29788 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VtnP29788 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
VtnP29788 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
VtnP29788 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VtnP29788 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VtnP29788 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
VtnP29788 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VtnP29788 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VtnP29788 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VtnP29788 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VtnP29788 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VtnP29788 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VtnP29788 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VtnP29788 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VtnP29788 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VtnP29788 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VtnP29788 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
VtnP29788 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
VtnP29788 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VtnP29788 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VtnP29788 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VtnP29788 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
VtnP29788 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VtnP29788 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
VtnP29788 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VtnP29788 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VtnP29788 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VtnP29788 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VtnP29788 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms