Protein–RNA interactions for Protein: P23950

Zfp36l1, mRNA decay activator protein ZFP36L1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp36l1P23950 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp36l1P23950 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp36l1P23950 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp36l1P23950 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp36l1P23950 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp36l1P23950 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp36l1P23950 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp36l1P23950 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp36l1P23950 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp36l1P23950 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp36l1P23950 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp36l1P23950 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp36l1P23950 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp36l1P23950 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp36l1P23950 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp36l1P23950 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp36l1P23950 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp36l1P23950 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp36l1P23950 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp36l1P23950 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp36l1P23950 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp36l1P23950 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp36l1P23950 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp36l1P23950 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp36l1P23950 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp36l1P23950 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp36l1P23950 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp36l1P23950 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp36l1P23950 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp36l1P23950 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp36l1P23950 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp36l1P23950 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp36l1P23950 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp36l1P23950 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp36l1P23950 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp36l1P23950 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp36l1P23950 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp36l1P23950 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp36l1P23950 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp36l1P23950 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Zfp36l1P23950 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Zfp36l1P23950 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Zfp36l1P23950 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Zfp36l1P23950 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Zfp36l1P23950 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Zfp36l1P23950 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Zfp36l1P23950 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Zfp36l1P23950 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Zfp36l1P23950 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Zfp36l1P23950 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Zfp36l1P23950 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Zfp36l1P23950 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp36l1P23950 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp36l1P23950 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp36l1P23950 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp36l1P23950 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp36l1P23950 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp36l1P23950 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp36l1P23950 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp36l1P23950 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp36l1P23950 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp36l1P23950 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp36l1P23950 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp36l1P23950 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp36l1P23950 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp36l1P23950 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp36l1P23950 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp36l1P23950 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp36l1P23950 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp36l1P23950 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp36l1P23950 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp36l1P23950 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp36l1P23950 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp36l1P23950 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp36l1P23950 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp36l1P23950 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp36l1P23950 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp36l1P23950 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp36l1P23950 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp36l1P23950 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp36l1P23950 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp36l1P23950 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp36l1P23950 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp36l1P23950 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp36l1P23950 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp36l1P23950 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp36l1P23950 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp36l1P23950 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp36l1P23950 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp36l1P23950 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp36l1P23950 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp36l1P23950 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp36l1P23950 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp36l1P23950 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp36l1P23950 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp36l1P23950 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp36l1P23950 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp36l1P23950 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp36l1P23950 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp36l1P23950 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms