Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
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Ggta1P23336 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Ggta1P23336 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms