Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Fcer1aP20489 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Fcer1aP20489 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Fcer1aP20489 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Fcer1aP20489 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Fcer1aP20489 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Fcer1aP20489 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Fcer1aP20489 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Fcer1aP20489 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Fcer1aP20489 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Fcer1aP20489 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Fcer1aP20489 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Fcer1aP20489 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Fcer1aP20489 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Fcer1aP20489 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
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Fcer1aP20489 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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