Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NefhP19246 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NefhP19246 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NefhP19246 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NefhP19246 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NefhP19246 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NefhP19246 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NefhP19246 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NefhP19246 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NefhP19246 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NefhP19246 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NefhP19246 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NefhP19246 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NefhP19246 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NefhP19246 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NefhP19246 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NefhP19246 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NefhP19246 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NefhP19246 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NefhP19246 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NefhP19246 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NefhP19246 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NefhP19246 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NefhP19246 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NefhP19246 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NefhP19246 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NefhP19246 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NefhP19246 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NefhP19246 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NefhP19246 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NefhP19246 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NefhP19246 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NefhP19246 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NefhP19246 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NefhP19246 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NefhP19246 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NefhP19246 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NefhP19246 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NefhP19246 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NefhP19246 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NefhP19246 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NefhP19246 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NefhP19246 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NefhP19246 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NefhP19246 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NefhP19246 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NefhP19246 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NefhP19246 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NefhP19246 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NefhP19246 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NefhP19246 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NefhP19246 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NefhP19246 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NefhP19246 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NefhP19246 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NefhP19246 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NefhP19246 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NefhP19246 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NefhP19246 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NefhP19246 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NefhP19246 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NefhP19246 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NefhP19246 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NefhP19246 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NefhP19246 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NefhP19246 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NefhP19246 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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NefhP19246 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NefhP19246 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NefhP19246 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NefhP19246 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NefhP19246 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NefhP19246 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NefhP19246 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NefhP19246 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NefhP19246 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NefhP19246 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NefhP19246 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NefhP19246 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NefhP19246 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NefhP19246 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NefhP19246 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NefhP19246 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NefhP19246 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
NefhP19246 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NefhP19246 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NefhP19246 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NefhP19246 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NefhP19246 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NefhP19246 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
NefhP19246 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NefhP19246 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NefhP19246 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NefhP19246 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NefhP19246 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NefhP19246 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NefhP19246 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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