Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18529 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18529 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
P18529 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18529 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18529 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
P18529 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18529 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
P18529 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18529 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18529 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18529 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
P18529 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18529 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18529 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
P18529 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18529 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18529 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18529 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18529 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18529 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18529 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18529 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18529 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18529 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18529 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18529 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18529 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18529 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18529 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18529 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18529 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18529 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18529 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18529 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18529 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18529 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18529 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18529 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18529 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18529 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18529 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
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P18529 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18529 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
P18529 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
P18529 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18529 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18529 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18529 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18529 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
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P18529 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
P18529 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
P18529 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18529 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18529 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
P18529 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18529 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18529 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18529 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
P18529 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18529 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18529 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18529 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18529 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
P18529 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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P18529 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18529 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18529 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18529 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18529 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18529 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18529 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18529 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18529 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18529 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18529 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18529 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18529 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18529 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18529 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18529 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18529 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18529 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18529 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18529 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
P18529 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18529 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18529 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18529 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18529 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18529 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
P18529 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18529 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18529 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18529 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
P18529 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18529 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
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