Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Thsd7a-206ENSMUST00000172356 10998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Eif2ak4-201ENSMUST00000005233 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms