Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
OtcP11725 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
OtcP11725 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
OtcP11725 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
OtcP11725 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
OtcP11725 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
OtcP11725 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
OtcP11725 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
OtcP11725 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
OtcP11725 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
OtcP11725 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
OtcP11725 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
OtcP11725 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
OtcP11725 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
OtcP11725 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
OtcP11725 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
OtcP11725 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
OtcP11725 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
OtcP11725 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
OtcP11725 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
OtcP11725 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
OtcP11725 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
OtcP11725 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
OtcP11725 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
OtcP11725 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
OtcP11725 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
OtcP11725 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
OtcP11725 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
OtcP11725 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
OtcP11725 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
OtcP11725 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
OtcP11725 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
OtcP11725 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
OtcP11725 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
OtcP11725 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
OtcP11725 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
OtcP11725 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
OtcP11725 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
OtcP11725 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
OtcP11725 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
OtcP11725 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
OtcP11725 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
OtcP11725 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
OtcP11725 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
OtcP11725 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
OtcP11725 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
OtcP11725 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
OtcP11725 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
OtcP11725 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
OtcP11725 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
OtcP11725 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
OtcP11725 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
OtcP11725 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
OtcP11725 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
OtcP11725 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
OtcP11725 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
OtcP11725 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
OtcP11725 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
OtcP11725 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
OtcP11725 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
OtcP11725 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
OtcP11725 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
OtcP11725 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
OtcP11725 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
OtcP11725 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
OtcP11725 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
OtcP11725 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
OtcP11725 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
OtcP11725 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
OtcP11725 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
OtcP11725 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
OtcP11725 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
OtcP11725 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
OtcP11725 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
OtcP11725 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
OtcP11725 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
OtcP11725 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
OtcP11725 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
OtcP11725 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
OtcP11725 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
OtcP11725 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
OtcP11725 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
OtcP11725 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
OtcP11725 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
OtcP11725 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
OtcP11725 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
OtcP11725 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
OtcP11725 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
OtcP11725 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
OtcP11725 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
OtcP11725 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
OtcP11725 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
OtcP11725 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
OtcP11725 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
OtcP11725 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
OtcP11725 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
OtcP11725 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
OtcP11725 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
OtcP11725 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
OtcP11725 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.5 ms