Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
DmdP11531 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
DmdP11531 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
DmdP11531 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
DmdP11531 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
DmdP11531 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
DmdP11531 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
DmdP11531 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
DmdP11531 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
DmdP11531 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
DmdP11531 Gm28651-201ENSMUST00000185335 644 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
DmdP11531 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
DmdP11531 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
DmdP11531 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
DmdP11531 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
DmdP11531 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
DmdP11531 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
DmdP11531 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
DmdP11531 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
DmdP11531 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
DmdP11531 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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DmdP11531 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
DmdP11531 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
DmdP11531 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
DmdP11531 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
DmdP11531 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
DmdP11531 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
DmdP11531 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
DmdP11531 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
DmdP11531 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
DmdP11531 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
DmdP11531 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
DmdP11531 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
DmdP11531 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
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DmdP11531 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
DmdP11531 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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DmdP11531 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
DmdP11531 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
DmdP11531 Gm5907-202ENSMUST00000210969 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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DmdP11531 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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DmdP11531 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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DmdP11531 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
DmdP11531 Gm31138-201ENSMUST00000212296 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
DmdP11531 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
DmdP11531 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
DmdP11531 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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DmdP11531 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
DmdP11531 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
DmdP11531 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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DmdP11531 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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DmdP11531 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
DmdP11531 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
DmdP11531 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
DmdP11531 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
DmdP11531 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
DmdP11531 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
DmdP11531 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
DmdP11531 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
DmdP11531 Gm6564-201ENSMUST00000075377 619 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
DmdP11531 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
DmdP11531 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
DmdP11531 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
DmdP11531 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
DmdP11531 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
DmdP11531 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
DmdP11531 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
DmdP11531 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
DmdP11531 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
DmdP11531 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
DmdP11531 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
DmdP11531 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
DmdP11531 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
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DmdP11531 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
DmdP11531 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
DmdP11531 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
DmdP11531 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
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