Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P10404 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P10404 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P10404 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P10404 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P10404 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P10404 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P10404 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P10404 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P10404 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P10404 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P10404 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P10404 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P10404 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P10404 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P10404 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P10404 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P10404 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P10404 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P10404 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P10404 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P10404 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P10404 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P10404 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P10404 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P10404 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P10404 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P10404 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P10404 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P10404 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P10404 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P10404 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P10404 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P10404 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P10404 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P10404 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P10404 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P10404 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P10404 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P10404 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P10404 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P10404 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P10404 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P10404 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P10404 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P10404 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P10404 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P10404 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P10404 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P10404 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P10404 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P10404 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P10404 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P10404 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P10404 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P10404 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P10404 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P10404 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
P10404 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P10404 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P10404 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P10404 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P10404 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P10404 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P10404 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
P10404 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P10404 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P10404 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P10404 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P10404 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P10404 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P10404 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P10404 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
P10404 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
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P10404 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P10404 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P10404 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P10404 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P10404 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P10404 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P10404 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
P10404 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P10404 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P10404 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
P10404 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P10404 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P10404 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P10404 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P10404 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P10404 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P10404 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
P10404 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P10404 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P10404 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P10404 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P10404 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P10404 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
P10404 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P10404 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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