Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms