Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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H2-Eb1P04230 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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