Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P01649 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P01649 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
P01649 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
P01649 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P01649 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P01649 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
P01649 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P01649 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P01649 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P01649 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P01649 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P01649 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P01649 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P01649 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
P01649 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
P01649 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P01649 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
P01649 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P01649 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P01649 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P01649 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P01649 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P01649 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
P01649 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P01649 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
P01649 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P01649 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P01649 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P01649 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P01649 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P01649 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P01649 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P01649 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P01649 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P01649 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P01649 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P01649 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
P01649 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P01649 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P01649 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P01649 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P01649 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
P01649 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P01649 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
P01649 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P01649 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P01649 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P01649 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P01649 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P01649 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
P01649 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
P01649 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P01649 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
P01649 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P01649 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P01649 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P01649 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P01649 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P01649 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P01649 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P01649 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P01649 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
P01649 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P01649 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
P01649 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P01649 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P01649 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P01649 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P01649 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
P01649 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
P01649 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
P01649 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
P01649 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
P01649 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
P01649 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
P01649 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
P01649 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
P01649 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.72
P01649 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
P01649 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
P01649 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P01649 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P01649 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P01649 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P01649 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
P01649 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
P01649 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P01649 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P01649 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
P01649 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
P01649 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P01649 Gm15904-201ENSMUST00000154515 487 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
P01649 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P01649 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
P01649 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
P01649 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
P01649 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P01649 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
P01649 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.7 ms