Protein–RNA interactions for Protein: O55038

Cxcl13, C-X-C motif chemokine 13, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl13O55038 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcl13O55038 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcl13O55038 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcl13O55038 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcl13O55038 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcl13O55038 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcl13O55038 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcl13O55038 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcl13O55038 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcl13O55038 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcl13O55038 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcl13O55038 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcl13O55038 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcl13O55038 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcl13O55038 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcl13O55038 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcl13O55038 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcl13O55038 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcl13O55038 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcl13O55038 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms