Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
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BckdkO55028 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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BckdkO55028 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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BckdkO55028 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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BckdkO55028 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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BckdkO55028 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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BckdkO55028 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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BckdkO55028 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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BckdkO55028 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BckdkO55028 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
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BckdkO55028 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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BckdkO55028 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
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