Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Tmsb15b1-201ENSMUST00000113071 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Sult1b1-203ENSMUST00000120150 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Vmn1r-ps107-201ENSMUST00000121458 581 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Lhx8O35652 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 1700031L13Rik-204ENSMUST00000188072 812 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Gm3496-201ENSMUST00000188283 745 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Gm42581-201ENSMUST00000201774 966 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 AC154742.1-201ENSMUST00000223477 573 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 AC154838.2-201ENSMUST00000226602 747 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Lhx8O35652 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Olfr1180-201ENSMUST00000099824 1063 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Prkg2-204ENSMUST00000162147 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Lhx8O35652 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Lhx8O35652 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Lhx8O35652 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Gm14781-201ENSMUST00000078469 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Gm15754-201ENSMUST00000119191 478 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Gm29191-201ENSMUST00000185427 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Lhx8O35652 Gm28486-201ENSMUST00000188443 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Gm28927-201ENSMUST00000191528 272 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Gm34716-201ENSMUST00000194060 621 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms