Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clk2O35491 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clk2O35491 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clk2O35491 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clk2O35491 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clk2O35491 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Clk2O35491 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clk2O35491 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clk2O35491 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clk2O35491 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Clk2O35491 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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