Protein–RNA interactions for Protein: O35309

Nmi, N-myc-interactor, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmiO35309 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NmiO35309 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NmiO35309 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NmiO35309 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NmiO35309 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NmiO35309 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NmiO35309 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NmiO35309 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NmiO35309 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NmiO35309 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NmiO35309 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NmiO35309 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NmiO35309 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NmiO35309 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NmiO35309 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NmiO35309 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NmiO35309 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NmiO35309 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NmiO35309 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NmiO35309 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NmiO35309 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NmiO35309 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NmiO35309 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NmiO35309 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NmiO35309 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NmiO35309 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NmiO35309 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NmiO35309 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NmiO35309 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NmiO35309 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NmiO35309 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NmiO35309 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NmiO35309 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NmiO35309 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NmiO35309 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NmiO35309 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NmiO35309 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NmiO35309 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NmiO35309 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NmiO35309 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NmiO35309 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NmiO35309 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NmiO35309 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NmiO35309 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NmiO35309 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NmiO35309 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NmiO35309 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NmiO35309 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NmiO35309 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NmiO35309 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NmiO35309 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NmiO35309 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NmiO35309 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NmiO35309 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NmiO35309 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NmiO35309 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NmiO35309 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NmiO35309 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NmiO35309 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NmiO35309 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NmiO35309 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NmiO35309 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NmiO35309 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NmiO35309 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NmiO35309 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NmiO35309 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NmiO35309 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NmiO35309 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NmiO35309 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NmiO35309 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NmiO35309 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NmiO35309 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NmiO35309 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NmiO35309 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NmiO35309 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NmiO35309 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NmiO35309 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NmiO35309 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NmiO35309 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NmiO35309 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NmiO35309 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NmiO35309 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NmiO35309 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NmiO35309 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NmiO35309 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NmiO35309 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NmiO35309 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NmiO35309 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NmiO35309 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NmiO35309 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NmiO35309 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NmiO35309 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NmiO35309 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NmiO35309 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NmiO35309 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NmiO35309 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NmiO35309 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NmiO35309 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NmiO35309 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NmiO35309 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms