Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Casq1O09165 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Casq1O09165 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Casq1O09165 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Casq1O09165 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Casq1O09165 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
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Casq1O09165 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Casq1O09165 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Casq1O09165 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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