Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hps1O08983 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hps1O08983 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hps1O08983 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Hps1O08983 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hps1O08983 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hps1O08983 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hps1O08983 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hps1O08983 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hps1O08983 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hps1O08983 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hps1O08983 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hps1O08983 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hps1O08983 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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