Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Efna3O08545 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efna3O08545 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efna3O08545 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efna3O08545 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Efna3O08545 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Efna3O08545 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Efna3O08545 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Efna3O08545 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms