Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Gm3336J3QMQ6 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Gm3336J3QMQ6 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Gm3336J3QMQ6 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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