Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Gm21818J3KMS6 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Gm21818J3KMS6 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
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