Protein–RNA interactions for Protein: G5E8J6

Hrc, Histidine rich calcium binding protein, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HrcG5E8J6 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HrcG5E8J6 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms