Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm10378F6XQQ1 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm10378F6XQQ1 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm10378F6XQQ1 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm10378F6XQQ1 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm10378F6XQQ1 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm10378F6XQQ1 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm10378F6XQQ1 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm10378F6XQQ1 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm10378F6XQQ1 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm10378F6XQQ1 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm10378F6XQQ1 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm10378F6XQQ1 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm10378F6XQQ1 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm10378F6XQQ1 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm10378F6XQQ1 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm10378F6XQQ1 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm10378F6XQQ1 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm10378F6XQQ1 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm10378F6XQQ1 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm10378F6XQQ1 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm10378F6XQQ1 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm10378F6XQQ1 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm10378F6XQQ1 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm10378F6XQQ1 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm10378F6XQQ1 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm10378F6XQQ1 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm10378F6XQQ1 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm10378F6XQQ1 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm10378F6XQQ1 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm10378F6XQQ1 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Gm10378F6XQQ1 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm10378F6XQQ1 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm10378F6XQQ1 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm10378F6XQQ1 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm10378F6XQQ1 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Gm10378F6XQQ1 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm10378F6XQQ1 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Gm10378F6XQQ1 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm10378F6XQQ1 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm10378F6XQQ1 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm10378F6XQQ1 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm10378F6XQQ1 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm10378F6XQQ1 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm10378F6XQQ1 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm10378F6XQQ1 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm10378F6XQQ1 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Gm10378F6XQQ1 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm10378F6XQQ1 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm10378F6XQQ1 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Gm10378F6XQQ1 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm10378F6XQQ1 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm10378F6XQQ1 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm10378F6XQQ1 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm10378F6XQQ1 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Gm10378F6XQQ1 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Gm10378F6XQQ1 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm10378F6XQQ1 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Gm10378F6XQQ1 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm10378F6XQQ1 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm10378F6XQQ1 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm10378F6XQQ1 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm10378F6XQQ1 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm10378F6XQQ1 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm10378F6XQQ1 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm10378F6XQQ1 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm10378F6XQQ1 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm10378F6XQQ1 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm10378F6XQQ1 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm10378F6XQQ1 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm10378F6XQQ1 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm10378F6XQQ1 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm10378F6XQQ1 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm10378F6XQQ1 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm10378F6XQQ1 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
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