Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
Cttnbp2B9EJA2 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
Cttnbp2B9EJA2 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Cttnbp2B9EJA2 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Cttnbp2B9EJA2 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cttnbp2B9EJA2 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms