Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Clrn2B2RVW2 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Clrn2B2RVW2 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Clrn2B2RVW2 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Clrn2B2RVW2 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Clrn2B2RVW2 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Clrn2B2RVW2 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Clrn2B2RVW2 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Clrn2B2RVW2 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Clrn2B2RVW2 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Clrn2B2RVW2 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Clrn2B2RVW2 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Clrn2B2RVW2 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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